В центре администирования автоматически было предложено обновиться с тогда текущей 3.0.8 на 3.0.11.
Скачал пакет, залил на фтп, после обновил форум по стандартной схеме из install.html, папку install переименовал и зашел на форум. В итоге перед глазами был чистый форум, без всех тем, сообщений и пользователей что были ранее.